Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
GferP56213 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GferP56213 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GferP56213 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms