Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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