Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcanP55066 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NcanP55066 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NcanP55066 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NcanP55066 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
NcanP55066 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NcanP55066 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NcanP55066 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NcanP55066 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NcanP55066 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NcanP55066 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NcanP55066 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NcanP55066 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NcanP55066 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcanP55066 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcanP55066 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NcanP55066 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NcanP55066 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NcanP55066 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcanP55066 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcanP55066 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NcanP55066 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcanP55066 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcanP55066 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcanP55066 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NcanP55066 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NcanP55066 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcanP55066 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NcanP55066 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcanP55066 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcanP55066 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcanP55066 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcanP55066 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcanP55066 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcanP55066 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcanP55066 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcanP55066 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcanP55066 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcanP55066 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcanP55066 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcanP55066 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcanP55066 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcanP55066 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NcanP55066 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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