Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Hoxc13P50207 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Hoxc13P50207 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Hoxc13P50207 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Hoxc13P50207 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Hoxc13P50207 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Hoxc13P50207 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Hoxc13P50207 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Hoxc13P50207 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Hoxc13P50207 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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