Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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PtpreP49446 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpreP49446 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpreP49446 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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PtpreP49446 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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PtpreP49446 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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PtpreP49446 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PtpreP49446 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PtpreP49446 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PtpreP49446 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpreP49446 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpreP49446 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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