Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nedd4P46935 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nedd4P46935 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Nedd4P46935 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Nedd4P46935 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Nedd4P46935 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Nedd4P46935 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Nedd4P46935 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Nedd4P46935 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Nedd4P46935 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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