Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp4P35123 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp4P35123 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp4P35123 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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