Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NapbP28663 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NapbP28663 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms