Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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PdgfraP26618 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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PdgfraP26618 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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PdgfraP26618 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PdgfraP26618 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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