Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SftpcP21841 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SftpcP21841 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SftpcP21841 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SftpcP21841 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SftpcP21841 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SftpcP21841 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms