Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P20040 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms