Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

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Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NefhP19246 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NefhP19246 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NefhP19246 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NefhP19246 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NefhP19246 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NefhP19246 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NefhP19246 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NefhP19246 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NefhP19246 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NefhP19246 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NefhP19246 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NefhP19246 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NefhP19246 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NefhP19246 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NefhP19246 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NefhP19246 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NefhP19246 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NefhP19246 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NefhP19246 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NefhP19246 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NefhP19246 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NefhP19246 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NefhP19246 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NefhP19246 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NefhP19246 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NefhP19246 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NefhP19246 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NefhP19246 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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