Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P18533 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P18533 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P18533 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18533 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms