Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
P18528 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
P18528 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
P18528 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
P18528 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
P18528 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
P18528 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
P18528 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
P18528 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
P18528 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
P18528 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
P18528 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
P18528 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
P18528 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
P18528 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
P18528 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
P18528 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
P18528 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
P18528 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
P18528 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
P18528 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
P18528 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
P18528 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
P18528 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
P18528 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
P18528 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
P18528 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
P18528 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
P18528 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
P18528 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18528 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18528 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18528 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18528 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18528 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
P18528 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18528 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18528 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18528 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18528 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18528 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18528 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18528 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18528 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18528 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18528 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18528 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18528 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18528 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18528 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18528 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18528 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18528 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
P18528 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms