Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms