Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms