Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb7P09024 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms