Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccl20O89093 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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