Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops6O88545 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops6O88545 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops6O88545 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Cops6O88545 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cops6O88545 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cops6O88545 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Cops6O88545 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Cops6O88545 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Cops6O88545 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Cops6O88545 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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