Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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