Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Smarce1O54941 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Smarce1O54941 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Smarce1O54941 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Smarce1O54941 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Smarce1O54941 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Smarce1O54941 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Smarce1O54941 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smarce1O54941 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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