Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq1O09165 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casq1O09165 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casq1O09165 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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