Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Sec22bO08547 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Sec22bO08547 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.6 ms