Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20939L7N243 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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