Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms