Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Gm3336J3QMQ6 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3336J3QMQ6 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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