Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms