Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Taf4bG5E8Z2 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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