Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Slc25a45-201ENSMUST00000025732 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Actr2-201ENSMUST00000000137 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Zic3-201ENSMUST00000088627 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Lrba-206ENSMUST00000195524 3322 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20517G3UVU6 Lpin3-201ENSMUST00000040872 3458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms