Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LctF8VPT3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LctF8VPT3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LctF8VPT3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LctF8VPT3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LctF8VPT3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LctF8VPT3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LctF8VPT3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LctF8VPT3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LctF8VPT3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LctF8VPT3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LctF8VPT3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LctF8VPT3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LctF8VPT3 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LctF8VPT3 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LctF8VPT3 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LctF8VPT3 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LctF8VPT3 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LctF8VPT3 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LctF8VPT3 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LctF8VPT3 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LctF8VPT3 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LctF8VPT3 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LctF8VPT3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LctF8VPT3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LctF8VPT3 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LctF8VPT3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LctF8VPT3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LctF8VPT3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms