Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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