Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddx60E9PZQ1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms