Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc17E9PVB5 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc17E9PVB5 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc17E9PVB5 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc17E9PVB5 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc17E9PVB5 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc17E9PVB5 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc17E9PVB5 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc17E9PVB5 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc17E9PVB5 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc17E9PVB5 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc17E9PVB5 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc17E9PVB5 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc17E9PVB5 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc17E9PVB5 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc17E9PVB5 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc17E9PVB5 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc17E9PVB5 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc17E9PVB5 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc17E9PVB5 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc17E9PVB5 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc17E9PVB5 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc17E9PVB5 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc17E9PVB5 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc17E9PVB5 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ttc17E9PVB5 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ttc17E9PVB5 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ttc17E9PVB5 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ttc17E9PVB5 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc17E9PVB5 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms