Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms