Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm5483B2RV77 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5483B2RV77 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gm5483B2RV77 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gm5483B2RV77 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gm5483B2RV77 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Gm5483B2RV77 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gm5483B2RV77 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gm5483B2RV77 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gm5483B2RV77 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gm5483B2RV77 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gm5483B2RV77 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5483B2RV77 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gm5483B2RV77 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gm5483B2RV77 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gm5483B2RV77 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm5483B2RV77 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm5483B2RV77 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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