Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms