Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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PtprbB2RU80 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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PtprbB2RU80 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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PtprbB2RU80 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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PtprbB2RU80 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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PtprbB2RU80 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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PtprbB2RU80 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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PtprbB2RU80 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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PtprbB2RU80 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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