Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms