Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Skint4A7TZF3 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Skint4A7TZF3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Skint4A7TZF3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Skint4A7TZF3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Skint4A7TZF3 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Skint4A7TZF3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skint4A7TZF3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skint4A7TZF3 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skint4A7TZF3 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skint4A7TZF3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skint4A7TZF3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skint4A7TZF3 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skint4A7TZF3 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skint4A7TZF3 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skint4A7TZF3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skint4A7TZF3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skint4A7TZF3 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skint4A7TZF3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skint4A7TZF3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skint4A7TZF3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skint4A7TZF3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skint4A7TZF3 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skint4A7TZF3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skint4A7TZF3 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skint4A7TZF3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skint4A7TZF3 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skint4A7TZF3 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skint4A7TZF3 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Skint4A7TZF3 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skint4A7TZF3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skint4A7TZF3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Skint4A7TZF3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skint4A7TZF3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms