Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms