Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc163A2AGD7 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms