Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vstm4T1NXB5 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms