Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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