Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn9Q9Z0S7 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn9Q9Z0S7 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn9Q9Z0S7 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn9Q9Z0S7 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn9Q9Z0S7 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Cldn9Q9Z0S7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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