Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PplQ9R269 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PplQ9R269 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PplQ9R269 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PplQ9R269 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PplQ9R269 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PplQ9R269 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PplQ9R269 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PplQ9R269 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PplQ9R269 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PplQ9R269 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PplQ9R269 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PplQ9R269 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PplQ9R269 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PplQ9R269 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PplQ9R269 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PplQ9R269 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PplQ9R269 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms