Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ercc4Q9QZD4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ercc4Q9QZD4 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ercc4Q9QZD4 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ercc4Q9QZD4 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ercc4Q9QZD4 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ercc4Q9QZD4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ercc4Q9QZD4 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ercc4Q9QZD4 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ercc4Q9QZD4 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ercc4Q9QZD4 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ercc4Q9QZD4 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ercc4Q9QZD4 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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