Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms