Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Ccl28Q9JIL2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Ccl28Q9JIL2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Ccl28Q9JIL2 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ccl28Q9JIL2 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ccl28Q9JIL2 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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