Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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