Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms